Вот как это удобно разложить в три стопки — по тем правилам, которые обычно требуют на разборе приставок.

1) Приставки, не изменяющиеся на письме

(их пишем всегда одинаково, независимо от следующей буквы)

• в-, на-, за-, под-, над-, от-, об-, до-, по-, про-, пере-, пред-
  Примеры: вбежать, написать, заглянуть, подземный, надпись, отнести, обвести, довести, поехать, проезд, переписать, предсказать.

• Иноязычные неизменяемые: меж-, сверх-, контр-, пан-, пост-, суб-, транс-, ультра-, супер-, анти-, де-, дис-
  Примеры: межвузовский, сверхмощный, контрпример, постсоветский, субподряд, трансевропейский, ультракороткий, суперигра, антициклон, дисгармония.

2) Приставки на -З/-С (з/с выбираем по звонкости/глухости следующего согласного)

Правило: перед звонкими согласными пишем -з-, перед глухими — -с-.

• без-/бес-: безвкусный, безграмотный ← (в, г — звонкие); бескровный, бестактный, бессмысленный ← (к, т, с — глухие).

• воз-/вос-: воздвигнуть, возжаловаться; восстановить, восписать.

• из-/ис-: издать, избойник; испечь, искра.

• раз-/рас-: разбудить, развести; раскрыть, расписать, рассказать.

• вз-/вс-: взбежать, взвести; вскрыть, встряска.

• низ-/нис-: низвергнуть; нисходящий.

• чрез-/черес- (устойчивые и книжные формы): чрезмерный; чересчур (фиксированное написание).

3) При-/Пре- (смысловые различия)

• ПРИ-

  1. Приближение, присоединение: пришить, приклеить, приехать, пристроить.

  2. Неполнота действия/легкая степень: приоткрыть, притушить, пригореть.

  3. Доведение до результата: придумать, приучить.

  4. Пространственная близость/находиться при чём-то: прибрежный, придомовой, пристанционный.

• ПРЕ-

  1. Значение «очень»: прекрасный (= очень красивый), превосходный, премудрый, пресытиться.

  2. Близко к значению пере- («через-, по-сверх-»): преступить (через ступень/запрет), преграда, преобразовать, преодолеть, превратить.

  3. Устойчивые слова, где пре- закрепилось исторически: пренебречь, презрение, презумпция.

Если бы нужно было «разложить» конкретные слова, я бы их распределил ровно по этим трём корзинам: сначала неизменяемые приставки, затем пары на з/с по озвончению/оглушению, и отдельно случаи с при-/пре- по смыслу (очень/пере- vs. при-ближение/неполнота/присоединение).