Корень в слове "школа"

Корень в слове «школа» — школ-.

Поясню разбор. Слово «школа» относится к существительным 1-го склонения; в форме именительного падежа ед. числа у него окончание -а. Основа слова — школ-, и именно она совпадает с корнем. Проверить легко по однокоренным словам и формам: школ-а, школ-ы, школь-н-ый, школь-ник — во всех случаях сохраняется сочетание школ-, а добавляются только суффиксы и окончания.