Слитно, раздельно или через дефис нужно писать данные местоимения: 1) что(же), 2) кто(бы)?

Правильно — раздельно: что же, кто бы.

Почему так: частицы же и бы (б) с местоимениями (и вообще с другими словами) пишутся раздельно, если они лишь придают оттенок значения: выделяют, уточняют, смягчают условность или предположение.
Примеры: Что же делать? / Кто бы мог подумать!

Не путайте с слитными формами-другими словами:

• чтобы/чтоб — это уже союз со значением цели или следствия: Чтобы успеть, выехали раньше.

• также, тоже — это наречия/союзы со значением присоединения/сопоставления: Он тоже пришёл; Также отметим…

Итого, в ваших примерах дефис не нужен, слитного написания нет: что же, кто бы.