Коротко: научное название вида — это бином из двух слов на латинском: название рода (с заглавной) + видовое название, или «видовой эпитет» (со строчной). Оба слова обычно курсивом: Genus species. Дальше — детали, по которым эти названия реально образуют.

Из чего делают названия

1. Род
   — Слово (чаще латинское или огреченное), ведёт себя как существительное в именительном падеже ед. числа: Homo, Canis, Quercus.
   — Может быть придумано автором «с нуля», но оформлено «по-латыни».
   — Всегда пишется с заглавной.

2. Видовой эпитет бывает трёх главных типов:
   а) Прилагательное, согласуется с родом по роду (m/f/n) и числу:
   Amanita muscaria (f), Larus argentatus (m), Quercus robur — тут «robur» не прилагательное, см. ниже.
   При переносе вида в другой род такое прилагательное меняет окончание: Rana temporaria → Pelophylax temporarius (если вдруг переехало к мужскому роду).

   б) Существительное в приложении (в именительном; не меняется при переносах):
   Canis lupus («волк» как существительное), Panthera leo. Окончание тут ни от чего больше не зависит — это отдельное имя существительное, стоящее рядом.

   в) Родительный падеж (генитив) — «кого/чего»:
   • В честь человека: муж. — -i (smithi), жен. — -ae (curiae); если фамилия на -ius, обычно -ii (nicolaiei → чаще nicolaii). Для нескольких людей: -orum (муж./смеш.), -arum (жен.).
   • От места/органа/объекта: Escherichia coli («кишки»), Salmonella typhi («тифозной» — от typhus в генитиве typhi).

   Есть и продуктивные суффиксы-модули: -ensis (из такого-то места, tokyoensis), -cola (обитатель), -phila (любитель), -vorus (пожиратель), -oides (похожий), -formis (формы такой-то), -gaster (с таким-то «животом/брюхом») и т. п.

Как пишут и оформляют

• Курсивом — Genus species. Автор и год (если указывают) — без курсива: Homo sapiens Linnaeus, 1758.

• Если вид перенесли в другой род, автора заключают в скобки: Xus y (Author, 1900) → Zus y (Author, 1900).

• Строчная буква у видового эпитета всегда, даже если это чья-то фамилия.

• Виды внутри одного рода не могут иметь совпадающих биномов, но одинаковые эпитеты у разных родов — обычное дело: vulgaris, officinalis, alba встречаются повсюду.

• Используются буквы латинского алфавита без диакритики; дефисы и пробелы внутри названия не ставят (видовое — одно слово).

Про грамматику и согласование

• У прилагательного эпитета окончание зависит от грамматического рода названия рода:
  m: -us/-er/-is, f: -a/-is, n: -um/-e.

• У существительного в приложении и у генитива окончание определяется самим словом, поэтому при смене рода «родового» названия они не меняются.

• Если фамилия «латинизируется», автор обычно делает это явным образом в оригинальном описании: так и фиксируется «правильная» форма генитива.

Подвиди и ниже

• Для подвидов и иных внутривидовых рангов добавляют третье слово (триномин): Canis lupus familiaris. Оно оформляется по тем же правилам (часто это прилагательное или существительное).

Откуда берут смысл

• Морфология/окраска (albus — белый, longirostris — длинноклювый).

• Место/среда (saxatilis — скальный, borealis — северный, baikalensis — из Байкала).

• В честь людей/групп (патронимы/матронимы: smithi, curiae, petroviorum).

• Поведение/питание/сходство (nocturnus, granivorus, feliformis).

• Иногда — каламбур или игра корней, но всё равно в рамках латинизации.

Разные «кодексы» — одни и те же базовые принципы

• У животных действуют правила зоологической номенклатуры, у растений/водорослей/грибов — ботанической; у прокариот — бактериологической; у вирусов — свои. Детали различаются (формальные требования к публикации, типам, приоритету), но бином и латинская грамматика у видов везде примерно одинаковые.

Мини-памятка для «своего» названия

1. Придумайте или выберите род (существительное в Nom. sg.).

2. Решите тип эпитета: прилагательное (тогда согласуйте род), существительное в приложении (не согласуется) или генитив (в честь кого/чего).

3. Запишите курсивом, с заглавной только у рода.

4. Проверьте, что такой бином ещё не занят в пределах рода, и что форма эпитета грамматически корректна.