В чём заключается преимущество покрытосеменных растений по отношению к голосеменным?

Коротко: покрытосеменные обогнали голосеменные потому, что размножаются и расселяются эффективнее, быстрее растут и гибче приспосабливаются. Главное — цветок, двойное оплодотворение и плод. Чуть подробнее по пунктам:

1. Цветок и опыление. У покрытосеменных есть специализированные цветки, часто с насекомыми и другими животными-опылителями. Это повышает точность переноса пыльцы и экономит «расход» пыльцы по сравнению с чисто ветроопыляемыми схемами.

2. Закрытый семязачаток. Семязачатки спрятаны в завязи; это физическая защита и «контроль доступа» пыльцевой трубки, меньше риск высыхания и повреждений.

3. Двойное оплодотворение и эндосперм. Питательная ткань (эндосперм) формируется только после успешного оплодотворения — ресурсы не тратятся зря. Эмбрион получает мощный старт.

4. Плод. Завязь превращается в плод, который одновременно защищает семена и помогает их распространению (животные, ветер, вода, «липучки», крылатки и т. п.). Это резко расширяет ареалы.

5. «Продвинутая» проводящая система. В ксилеме есть сосуды, а в флоэме — ситовидные трубки с клетками-спутницами. В сумме это быстрее гонит воду и сахара → выше темпы роста, можно быть травянистыми однолетниками и быстро захватывать пустующие места.
   (Есть исключения без сосудов, но в целом тренд именно такой.)

6. Быстрые жизненные циклы. Много однолетников и эфемеров: от семени до семени — за один сезон. Это ускоряет эволюцию и позволяет быстро реагировать на изменения среды.

7. Компактные гаметофиты и ускоренная репродукция. Женский гаметофит маленький, пыльцевая трубка быстро растёт — время от опыления до оплодотворения обычно короче, чем у голосеменных.

8. Механизмы генетической гибкости. Часты полиплоидия, самонесовместимость, разнообразные стратегии само-/перекрёстного опыления и даже апомиксис — всё это облегчает как сохранение, так и обновление генетического разнообразия.

9. Коэволюция с животными. Взаимные «союзы» с опылителями и распространителями семян привели к богатству форм и экологических ниш.

10. Экологическое доминирование. Благодаря перечисленному покрытосеменные составляют львиную долю современного растительного покрова Земли (кроме холодных бореальных и высокогорных зон, где чаще преобладают хвойные).

Итог: цветок → точное опыление; двойное оплодотворение → экономный старт семени; плод → защита + расселение; сосудисто-флоэмные «усовершенствования» → быстрый рост. В комплексе это даёт покрытосеменным эволюционное преимущество над голосеменными.