Что являлось органом центрального управления при Александре I?

Коротко: органом центрального управления при Александре I стала система министерств.

Чуть подробнее. В 1802 году Манифестом «Об учреждении министерств» Пётровские коллегии были заменены отраслевыми министерствами (иностранных дел, внутренних дел, финансов, юстиции, народного просвещения, коммерции, военное, морское и др.). Каждое министерство возглавлял министр, внутри действовали департаменты и канцелярии; принцип работы — единоначалие вместо прежней коллегиальности. Для согласования общих вопросов с 1802 г. действовал Комитет министров, а с 1810 г. как законосовещательный орган при императоре — Государственный совет. Но ядром центрального управления именно при Александре I была министерская система.