Есть ли у слова "территория" однокоренные слова?

Да. У «территория» есть целое словообразовательное гнездо, хоть и не очень широкое (слово заимствованное, поэтому производных меньше, чем у исконных). Самые употребительные однокоренные:

• территориальный — территориальные воды, территориальные претензии, территориальное деление;

• территориально — территориально разделены, территориально близкие районы;

• территориальность — принцип территориальности, признак территориальности.

К научно-публицистическим и терминологическим относятся:

• территориализация, детерриториализация, ретерриториализация — термины в социологии, географии, культурологии (процессы «привязки/отвязки» явлений к территории).

Также встречаются формы прилагательного: территориальна, территориально, территориальны (краткие формы) и субстантивированные сочетания типа территориальное (деление/управление).

Важно не путать с тематически близкими, но неоднокоренными словами вроде акватория, зона, область, регион — у них другой корень. Корневой элемент во всём гнезде — территор- (лат. terra «земля»).