Выделить корень слова "лимон".

Корень: лимон-.

Поясню. Это заимствованное существительное, в котором весь основной стяг — лимон-, а в форме им. п. ед. ч. окончание нулевое: лимон∅. Проверить легко по формам: лимон-а, к лимон-у, с лимон-ом — неизменная часть лимон- и есть корень. Однокоренные: лимонный, лимонник, лимонка — везде сохраняется корень лимон-.